„Fudanshi Koukou Seikatsu” to historia o Ryou Sakaguchi, zwykłym licealiście z jednym nietypowym hobby – jest fudanshi, czyli mężczyzną uwielbiającym czytać mangi typu „boys’ love”. Jego marzeniem jest znalezienie przyjaciół, którzy zrozumieją jego tajemniczą pasję. Marzenie Sakaguchi staje się rzeczywistością, kiedy zaczyna odkrywać, że wśród jego rówieśników jest wielu zainteresowanych tą tematyką. Towarzyszą mu w tym: Rumi Nishihara, zapalona fujoshi, przerysowany, otwarcie homoseksualny Yuujirou Shiratori, jego wierny wielbiciel Akira Ueda oraz Daigo, również fudanshi i popularny autor doujinshi. Na każdym kroku wspiera ich najbliższy przyjaciel Sakaguchi, Toshiaki Nakamura.