Jest rok 1860. Młody Isamu wraz ze swoim gepardem, Cheetahem, wyrusza na pełną przygód podróż morską, by odnaleźć zaginionego ojca. Gdy statek, którym płyną, zostaje zaatakowany przez tajemniczą istotę morską, bohaterowie trafiają do fantastycznego świata głęboko pod powierzchnią oceanu. Okazuje się, że podwodne królestwo jest zamieszkane przez niezwykłe stworzenia i posiada zaawansowaną technologię, której pozazdrościłby nawet świat na powierzchni.
W nowo odkrytym zakątku Isamu poznaje ludzi, którzy walczą z zagrożeniem ze strony dominującej, mrocznej siły planującej podporządkować sobie głębinowe miasta. Zafascynowany tajemnicami oceanu, chłopiec musi znaleźć w sobie odwagę i spryt, by odnaleźć ojca oraz pomóc nowym przyjaciołom. „Kaitei Sanman Mile” to pełne akcji anime o przyjaźni, odkrywaniu nieznanych zakątków świata i pokonywaniu przeciwności losu, ukazane w klasycznym, przygodowym stylu.
