„Kimi no Iru Machi” to historia o Haruto Kirishimie, który prowadził spokojne życie na wsi, z dala od szybkiego tempa miasta, aż do momentu, kiedy w jego życiu pojawiła się Yuzuki Eba. Pochodząca z Tokio dziewczyna wprowadza zamęt do dotychczasowej rzeczywistości Haruto. Gdy jednak niespodziewanie znika, Haruto pełen jest pytań i niepewności. Rzeczywistość staje się jeszcze bardziej skomplikowana, gdy Haruto decyduje się przeprowadzić do Tokio, gdzie spotyka się z trudnościami, nieporozumieniami i nowymi uczuciami. Głównym pytaniem, które przyświeca jego wyborom jest: czy Yuzuki, która unika go bez wyraźnych powodów, jest tą jedyną, czy może jest nią Asuka?