„Medarot” to seria o potężnych robotach – Medabotach, które dzięki specjalnym „medalom” otrzymały sztuczną inteligencję i służą na życzenie swoich właścicieli. Są one najczęściej używane w „Robbattlingu”, popularnym sporcie polegającym na walce dwóch Medabotów. Profesjonalni Medafighterzy używają swoich Medabotów, aby zakwalifikować się do Światowego Turnieju i walczyć ze światową elitą, aby zdobyć tytuł mistrza. Młody uczniów szkoły podstawowej, Ikki Tenryou, dopiero co zdobył swojego pierwszego Medabota: Metabee, nieco już przestarzały model, niestety bez medalu. Na szczęście, Ikki udaje się znaleźć medal w pobliskiej rzece, jednak po umieszczeniu go w głowie Metabee, ten zaczyna się dziwnie zachowywać. Wybuchowy i buntowniczy, odmawia posłuszeństwa Ikkiemu. Jednak aby awansować do Światowego Turnieju, Ikki i Metabee muszą najpierw nauczyć się współpracować, bez względu na to, jak trudne może się to wydawać…