„Sakura Trick” to historia o przyjaźni i związku dwóch dziewczyn – Haruka Takayama i Yuu Sonoda, które wspólnie uczęszczają do szkoły Misato West. Los jednak nie jest dla nich łaskawy – pomimo tego, że są w tej samej klasie, muszą siedzieć na przeciwnych końcach sali lekcyjnej. Co gorsza, ich szkoła ma zostać zamknięta za trzy lata. Mimo tych przeciwności, Haruka jest zdeterminowana, aby spędzić jak najwięcej czasu z Yuu i razem tworzyć niezapomniane wspomnienia. Wyrażając swoje uczucia, dziewczyny decydują się na intymny pocałunek, który zacieśnia ich więź i otwiera nowe aspekty ich przyjaźni, przynosząc jednocześnie nowe konflikty.