„Seiken Gakuin no Makentsukai” to barwna opowieść o Leonisie, Mrocznym Władcy, który budzi się po tysiącleciach magicznego snu w ciele dziesięcioletniego chłopca. Wyjątkowe zdolności Leonisa wykorzystuje nowa przyjaciółka, Riselia, do walki z Voids – potworami, które prawie doszczętnie zniszczyły ludzkość. Aby rozwikłać tajemnice nowej epoki, Leonis zapisuje się do Excalibur Academy – szkoły przygotowującej uczniów do walki z tajemniczymi monstrami. Czy Voids mają jakieś powiązanie z przeszłością Leonisa?