Ittoki Sakuraba, z pozoru zwyczajny licealista, wiedzie spokojne życie do chwili, gdy nieoczekiwanie odkrywa, że pochodzi z rodu ninja od pokoleń uwikłanego w sekretny konflikt z wrogim klanem. Nagle wciągnięty w świat pełen intryg i niebezpieczeństw, chłopak zmuszony jest do szybkiego opanowania sztuk shinobi, by chronić bliskich i przetrwać zaskakujące starcie klanów. Ittoki zmaga się z odpowiedzialnością, jaką nałożono na niego wraz ze skrywaną przez rodzinę spuścizną, jednocześnie próbując pogodzić życie szkolne z nowym, niecodziennym obowiązkiem. „Shinobi no Ittoki” to pełna akcji seria, utrzymana w poważnym tonie, która ukazuje drogę młodego bohatera ku dojrzałości, lojalności wobec przyjaciół i odkrywaniu własnej tożsamości w obliczu nieustannych zagrożeń ze strony rywalizujących rodzin ninja.
