Na odległej planecie Cybertron od wieków trwa wojna między dwiema frakcjami Transformerów: szlachetnymi Autobotami prowadzonymi przez Optymusa Prime’a a bezwzględnymi Decepticonami dowodzonymi przez Megatrona. Konflikt przenosi się na Ziemię, gdy obydwie strony odkrywają istnienie tajemniczych, niewielkich robotów zwanych Micronami. Te unikalne istoty posiadają ogromną moc, która może zmienić bieg odwiecznej wojny.
Przypadkiem trójka młodych ludzi — Rad, Carlos i Alexis — natrafia na Microny i zaprzyjaźnia się z nimi. Od tej chwili ich codzienność wypełniona zostaje walką o pokój oraz ochroną przyjaciół przed zagrożeniem ze strony Megatrona, który za wszelką cenę próbuje zdobyć potężne Microny. Serial, utrzymany w dynamicznym i emocjonującym tonie, opowiada o przygodzie, lojalności, przyjaźni, oraz sile współpracy, przybliżając zarówno nowych, jak i oddanych fanów, do świata legendarnych Transformerów.
