„Vatican Kiseki Chousakan” to anime o ojcach Josefie Kou Hiradze i Roberto Nicholasie, którzy jako Watykańscy Badacze Cudów sprawdzają autentyczność cudownych zjawisk zgłaszanych z całego świata. Każde na pozór święte wydarzenie kryje w sobie przerażające tajemnice, morderstwa i diabelskie kulty. Hiraga, geniusz nauk ścisłych, i Roberto, wszechstronny erudyta, muszą połączyć siły, aby odkryć prawdę. Czy ich przyjaźń i wiara przetrwają zło, które napotkają w drodze do prawdziwego cudu?