Akcja „Seikon no Qwaser: Jotei no Shouzou” ma miejsce w Akademii Świętej Mihailov, tajemniczej szkole pełnej sekretów i mrocznych intryg. Fabuła skupia się na losach Sashy, enigmatycznego wojownika znanego jako Qwaser, który posiada niezwykłą moc manipulowania jednym wybranym pierwiastkiem chemicznym. W tej serii OVA główni bohaterowie trafiają w sam środek nowego konfliktu, gdy w szkole pojawia się zagadkowy portret mający ścisły związek z dawną cesarzową. W poszukiwaniu prawdy Sasha oraz jego przyjaciele muszą stawić czoła groźnym przeciwnikom, jednocześnie stawiając czoła własnym słabościom i wewnętrznym demonom. Seria utrzymana jest w mrocznej atmosferze, przeplatanej dynamicznymi pojedynkami, elementami fanserwisu oraz nadprzyrodzonymi mocami, typowymi dla całego uniwersum Seikon no Qwaser.

