„Amagami-san Chi no Enmusubi” opowiada historię licealisty Uryū Kamihate, który marzy o dostaniu się na studia medyczne Uniwersytetu w Kioto. Po spędzeniu dzieciństwa w sierocińcu, Uryū trafia do sanktuarium Amagami, gdzie ku jego zdumieniu zostaje poproszony przez głównego kapłana, by poślubił jedną z jego trzech wnuczek. Bohater początkowo odrzuca ten pomysł, unikając romantycznych relacji i religijnego życia, ale z czasem zacieśnia relacje z siostrami Amagami. W tle tego wszystkiego widnieje groźba zamknięcia sanktuarium z powodów finansowych, co stawia bohaterów przed trudnymi wyborami i wyzwaniami. Zabawna, ciepła i pełna emocji historia toczy się wokół rozwoju postaci, ich wzajemnych relacji oraz dojrzewania Uryū, który stopniowo odkrywa piękno codzienności, jak i wartość więzi międzyludzkich.