„Anima Yell!” to historia o Kohane Hatoyi, która kocha pomagać innym bez względu na okoliczności. Po obejrzeniu pokazu cheerleaderek, Kohane postanawia założyć własny zespół cheerleaderek. Pomimo entuzjazmu, Kohane nie ma żadnego doświadczenia w cheerleadingu, co dodatkowo utrudnia sprawę. Dodatkowo, od dzieciństwa ma lęk wysokości, co jest dużym wyzwaniem w dyscyplinie pełnej akrobacji wysoko nad ziemią. Wszystko zaczyna się zmieniać, gdy poznaje Hizume Arimę, byłą cheerleaderkę, która pomimo początkowych oporów, zdecyduje się pomóc nowo powstałemu zespołowi.