„Ao no Miburo” to anime osadzone w roku 1863, podczas schyłku shogunatu, kiedy Japonia stoi na progu olbrzymich zmian. Fabuła skupia się na sierocie Nio, który pomimo brutalnej rzeczywistości, której doświadczył, tęskni za sprawiedliwością i dążeniem do zmiany świata na lepsze.
Pewnego dnia Nio spotyka dwóch mężczyzn, Hijikatę Toshizō i Okitę Souji, znanych później jako Miburo i późniejszych założycieli grupy Shinsengumi. Zainspirowany ich wysiłkami, Nio dołącza do ich szeregów, by przyczynić się do kształtowania nowego świata. Jednak wrzenie polityczne i zmieniające się lojalności codziennie próbują podważyć jego determinację. Czy Nio pozostanie wierny swoim ideałom?