„Betterman” to tajemnicza walka o przetrwanie ludzkości, zagrożonej śmiertelnym wirusem o nazwie „Algernon”. Tajna organizacja Akamatsu Industries, podszywająca się pod tokijską fabrykę ciężkiego sprzętu, używa neurologicznie wzmacnianych broni zwanych „NeuroNoidami” do zwalczania Algernon. Walce przysłużyć się ma też tajemnicza mutacja o nazwie „Betterman”.