„Big X” to niezwykła opowieść rozgrywająca się w czasie II Wojny Światowej. Początek opowieści przypada na moment, gdy Dr Asagumo zostaje zaproszony do nazistowskich Niemiec, aby współpracować przy badaniach nad nową bronią znaną jako „Big X”. Obawiając się możliwych konsekwencji, Dr Asagumo celowo opóźnia badania, ściśle współpracując ze swym współbadaczem, przebiegłym Dr. Englem. Przed końcem wojny, Dr Asagumo przekazuje sekret Big X swojemu synowi Shigeru i ginie zastrzelony przez niemiecką armię. Dwadzieścia lat później, tajemnica Big X zostaje odkryta w ciele Shigeru, który mieszka w Tokio. Organizacja, która utrzymuje, że jest sprzymierzeńcem nazistów, kradnie kartę z tajemnicą i kończy projekt Big X. Okazuje się, że „Big X” to narkotyk, który pozwala na nieograniczone powiększanie ludzkiego ciała. Syn Shigeru, Akira, nie boi się stanąć do walki z sojuszem nazistowskim i Hansem Englem, którzy planują podbój świata.