„Blue Eyes: In Harbor Tale” to anime osadzone w portowym mieście „Y”, gdzie wiele starych artefaktów ożywa po długim czasie, a kawałek cegły służy jako pilot dla „gości” z zagranicy. Pewnego dnia, ten ceglany bohater spotyka lalkę-dziewczynę na rzece co daje początek nowej, malutkiej historii.