Opowieść skupia się na losach studentów uniwersyteckich, którzy postanawiają przełamać stereotypy i stworzyć pierwszy w historii ich uczelni męski zespół cheerleaderów. Po kontuzji, która uniemożliwia mu dalszy trening judo, Haruki Bandou, młody chłopak poszukujący swego miejsca w świecie, decyduje się podjąć nowe wyzwanie. Zachęcony przez przyjaciela Kazumę Hashimoto, postanawia założyć drużynę cheerleadingową. Wkrótce, mierząc się z nietypowymi sytuacjami codziennego życia akademickiego i problemami dorastania, grupa młodych mężczyzn odkrywa znaczenie odwagi, przyjaźni i realizacji marzeń. „Cheer Danshi!!” to pełna energii i optymizmu historia o pokonywaniu życiowych trudności, sile współpracy, wsparciu oraz poszukiwaniu własnej tożsamości.