„Cobra The Animation: The Psycho-Gun” to pełna akcji kosmiczna opera, będąca mieszanką nauki, fantazji i piractwa. Główną bohaterką jest Utopia More, która odkrywa starożytny zapis mogący odsłonić tajemnice wszechświata. Staje się celem bezwzględnego Gypsy Doc z Gildii Piratów, lecz ratuje ją legendarny, beztroski kosmiczny pirat, Cobra, który swoim specjalnie wykonanym Psychogunem jest siłą, z którą trzeba się liczyć. Razem, starają się powstrzymać Gypsy Doc i jego starania o wykorzystanie sekretów zapisu do podporządkowania sobie wszechświata.