„Gaist Crusher” to dynamiczna historia, która toczy się w 2047 roku, kiedy człowiek odkrywa rzadki metal o nazwie „Gaimetal”. Posiada on ogromną ilość energii, co prowadzi do rozpoczęcia wydobycia na całym świecie. W 2075 roku ludzkość zaczyna być atakowana przez Gaist – stworzenia z metalu, którego ciała są pokryte „Gaimetalem”. Powołana zostaje specjalna organizacja – GCG (znana jako „Gaist Crusher Garrison”), której zadaniem jest walka z Gaist. W 2064 roku, GCG wprowadza do akcji „Gaist Crushers” – ludzi wyposażonych w specjalne zbroje wykonane z „Gaimetalu”, stawiając czoło nie tylko stworzeniom Gaist, ale także tajemniczej organizacji o nazwie „Erasers”.