„Gakusen Toshi Asterisk 2nd Season” kontynuuje historię uczniów Genestella – Ayato Amagiri i Julis-Alexia von Riessfeld, którzy po długim i wyczerpującym pojedynku z siostrami Irene i Priscillą Urzaiz awansowali do następnej rundy Phoenix Festa. Mimo najszczerszych starań Julis i Ayato, fakt, że moce Ayato zostały zapieczętowane, nie jest już tajemnicą. Teraz, będąc w dużym niekorzyści, muszą oni wymyślić plan, jeśli mają mieć jakiekolwiek nadzieje na wygranie Phoenix Festa. Jedno jest pewne: problemy, które nadchodzą, będą tylko coraz bardziej nie do pokonania.