„Good Morning Althea” opowiada historię o Nikolu, który jest częściowo cyborgiem, o Galorim, młodym chłopcu będącym częściowo człowiekiem, a częściowo członkiem rasy Crest, oraz o Althea, która jest w pełni członkinią rasy Crest. Ziemia i rasa Crest prowadziły ze sobą wojnę przez 300 lat, więc wciąż panują między nimi duże napięcia. Statek, na którym znajdują się Galory, Nikolai i inni, zostaje zaatakowany przez automatyczne statki bojowe z gigantycznego statku Crest, który został przejęty przez automatona. Galory, Nikolai i Althea udają się na statek, aby sprawdzić, czy są tam jacyś ocalali z zaawansowanej grupy z ich statku, i próbują zniszczyć automaton typu 38 w rdzeniu statku.