W odległej przyszłości, na powierzchni Ziemi rozciąga się ogromne wysypisko złomu przykryte mroczną rzeczywistością, będące jednocześnie domem dla wyrzutków społeczeństwa. Nad nim góruje utopijne, latające miasto Zalem, zamieszkane przez elitę. Pewnego dnia naukowiec Ido znajduje na złomowisku szczątki tajemniczej dziewczyny-cyborga, której nadaje imię Gally. Pozbawiona przeszłości Gally szybko przekonuje się o swej niezwykłej sile bojowej i próbuje odnaleźć sens istnienia w brutalnym świecie przemocy, korupcji i bezwzględnej walki o przetrwanie. Stopniowo odkrywając drzemiące w niej zdolności i konflikty pomiędzy nierównymi warstwami społecznymi, Gally rozpoczyna własną podróż ku odkryciu prawdy o sobie samej. „Gunnm” łączy cyberpunkową estetykę z filozoficzną refleksją nad istotą człowieczeństwa, tożsamości i moralności w świecie, w którym granice między człowiekiem a maszyną coraz bardziej się zacierają.

