„Haguregumo” to historia osadzona w roku 1866, w schyłkowym okresie ery Tokugawa w Japonii. W centrum narracji stoi postać byłego samuraja, Kumosuke Haguregumo, który teraz jest uważany za wioskowego błazna. Pomimo tego, że nadal nosi swoje podwójne katany, Kumosuke większość czasu spędza na paleniu fajki, piciu alkoholu i uwodzeniu kobiet. W domu na niego czekają zaniepokojona żona i dwójkę dzieci – Shinnosuke i Ohana. Nastolatek Shinnosuke, pragnąc zrozumieć świat dookoła siebie, próbuje żyć zgodnie z kodeksem honoru, co jest wyzwaniem w tych burzliwych czasach. Dotyczy to zarówno jego relacji z ojcem, jak i innych wojowników próbujących odnaleźć swoje miejsce w dynamicznie zmieniającej się rzeczywistości.