„Hakuouki Movie 1: Kyoto Ranbu” to opowieść o młodej Chizuru Yukimura, która przebrana za chłopca, udaje się do Kioto, aby odnaleźć swojego zaginionego ojca, lekarza o imieniu Koudou. Szybko przekonuje się, że stolica jest pełna niebezpieczeństw. Atakowana przez dwóch rōninów, Chizuru jest świadkiem, jak są oni zabijani przez tajemniczych samurajów o białych włosach i czerwonych oczach. Następnie zostaje zatrzymana przez Shinsengumi – specjalną jednostkę policyjną służącą siogunowi. Kiedy dowódca dowiaduje się, że poszukiwany przez nich mężczyzna to ojciec Chizuru, pozwala jej mieszkać pod ich opieką. Pracując jako asystentka dla Toshizou Hijikaty, drugiego w dowodzeniu Shinsengumi, Chizuru powoli odkrywa związki między burzliwym politycznym klimatem Kioto, dziwnymi samurajami a jej ojcem.