„Holy Knight” to opowieść o nieśmiałym sierocie, Mizumura Shincie, który uczęszcza do szkoły misjonarskiej w Tokio. Niespodziewanie, jego zwyczajne życie zmienia się, gdy do jego szkoły przenosi się piękna pół-człowiek, pół-Rumuńka, Lilith. Wkrótce Mizumura odkrywa, że jest łowcą wampirów i następcą rodu Romuald.