Główna bohaterka „Jewelpet Happiness”, Chiari Tsukikage, wraz ze swoimi przyjaciółmi zarządza Jewelpet Cafe. Pewnego dnia, w magicznym świecie Jewel Land, Lady Jewelina powierza Ruby Magiczne Pudełko Klejnotów z misją nawiązywania przyjaźni i zbierania Magicznych Klejnotów. Jednocześnie musi uczęszczać do Akademii Klejnotów, aby to zrobić i otworzyć sklep o nazwie Jewelpet Cafe. Jednak, mimo wsparcia przyjaciół, nie wszystko idzie zgodnie z planem, a uczniowie są przerażeni. Sytuacja zmienia się, kiedy Ruby spotyka młodą dziewczynę o imieniu Chiari Tsukikage. Teraz wszyscy muszą pracować razem, aby kawiarnia prosperowała, wspierać się zarówno w dobrych, jak i złych chwilach oraz chronić Pudełko Klejnotów przed kradzieżą.