„Junketsu no Maria” to historia o młodej i potężnej czarownicy Marii mieszkającej we Francji podczas Wojny Stuletniej. Zaniepokojona niewinnymi wpadającymi w wir wojny, Maria zaczyna używać swej magii, aby zapobiec dalszym konfliktom i utrzymaniu pokoju. Jej działania przyciągają jednak uwagę niebios, a arcyanioł Michał zostaje wysłany, aby powstrzymać jej ingerencję w sprawy ludzi. Maria, choć naznaczona piętnem heretyka, nie zamierza posłuchać ostrzeżeń i kontynuuje swoje wysiłki na rzecz pokoju. Tymczasem Kościół knuje, jak pozbawić czarownicę mocy i raz na zawsze zakończyć jej ingerencję.