„Kenka Banchou Otome: Girl Beats Boys” to historia Hinako Nakayamy, która całe swoje życie spędziła w państwowych domach dziecka, nie znając swojej rodziny. Kiedy ma rozpocząć naukę w szkole średniej, pojawia się Hikaru, chłopiec, który twierdzi, że jest jej bratem bliźniakiem.
Według Hikaru, są oni dziećmi szefa potężnej yakuzy Onigashima, a on chce, aby Hinako zastąpiła go w Shishiku Academy, szkole dla chłopców pełnej najtwardszych chuliganów w kraju. Czy Hinako poradzi sobie w nowej roli, uratuje brata, znajdzie miłość i stanie się nowym szefem szkoły?