„Kono Yo no Hate de Koi wo Utau Shoujo YU-NO” to historia młodego studenta, Takuyi Arimy, którego ojciec – historyk prowadzący różne badania – niedawno zniknął. W trakcie wakacji Takuya otrzymuje tajemniczą paczkę od swojego zaginionego ojca, w której znajduje się list informujący o istnieniu różnych równoległych światów. Początkowo traktuje to jako żart, ale niedługo potem odkrywa, że ma urządzenie, które pozwala mu podróżować do tych alternatywnych wymiarów. Czy jego ojciec żyje? Jeśli tak, to gdzie on jest?