„Kubo-san wa Mob wo Yurusanai” to historia Junty Shiraishi’ego, ucznia liceum, który pragnie po prostu cieszyć się młodością. Nie jest to jednak takie proste, gdyż Shiraishi jest praktycznie niewidoczny dla swoich rówieśników, a nawet nauczyciele często nie zauważają jego obecności. Według plotki, ten, kto go zauważy, otrzyma szczęście.
Jednak jest jedna osoba, która zawsze dostrzega Shiraishi’ego – Nagisa Kubo, zdecydowana nie pozwolić mu zniknąć w tle. Dla Shiraishi’ego, oznacza to oczywiście mnóstwo dziwnych sytuacji, wyreżyserowanych przez Kubo. Ale zabawki Kubo mogą okazać się katalizatorem, który pozwoli Shiraishi’emu doświadczyć wspaniałej młodości, o której marzy.