„M3: Sono Kuroki Hagane” to mroczna opowieść o grupie dzieci, które połączyło spotkanie w Bezkształtnym Królestwie, a oddzieliła rzeczywistość swojego własnego wymiaru. Po latach ponownie łączą siły, aby walczyć z potworami zwanymi „Napomnieniami”, za pomocą robotów zwanych „Vess”. Ich walka jednak tylko spowalnia nękające ich świat Bezkształtne Królestwo. Ich życie przyjmuje niepokojący obrót, kiedy pojawia się nowy wróg, „Trup”, którego pieśń zabija każdego, kto jej posłucha w ciągu dziewięciu dni. Po usłyszeniu „Pieśni Trupa”, życie każdego członka grupy zaczyna się komplikować, co zagraża losowi całej ludzkości.