„Medarot Damashii” to kontynuacja popularnej serii Medabots, która przedstawia kolejne przygody Ikki i Metabee. Spotykają oni tajemniczego wroga – Jinkaia i niebezpieczne Death Medabots. Wraz z Nae i Ericą, staną do walki, by pokonać Jinkai i Death Medabots.