„Meitantei Conan Movie 20: Junkoku no Nightmare” to emocjonujące anime, które rozgrywa się w ciemną noc, podczas której japońska policja zostaje zaatakowana przez szpiega. Szpieg próbuje przejąć tajne pliki różnych agencji wywiadowczych, takich jak MI6 z Wielkiej Brytanii, BND z Niemiec i CIA z Ameryki, ostatecznie jednak ucieka samochodem. Następnego dnia Conan i jego przyjaciele odwiedzają nowo odrestaurowane akwarium w Tokio, podczas którego Conan spotyka atrakcyjną, aczkolwiek ranną i cierpiącą na amnezję kobietę. Przyjaciele Conan’a starają się pomóc jej odzyskać pamięć, nieświadomi, że są obserwowani przez tajemniczą postać w tle.