Pewnego dnia chłopiec imieniem Tom odkrywa na ulicy tajemniczego, pomarańczowego kota, którego postanawia przygarnąć i nazwać Mikan. Wkrótce okazuje się, że Mikan nie jest zwyczajnym zwierzęciem—potrafi mówić, czytać, pisać, a swoje codzienne przeżycia utrwala w ilustrowanym pamiętniku. Seria ukazuje codzienne perypetie niezwykłego kota, jego relacje z rodziną Toma oraz ich przyjaciółmi, a także humorystyczne sytuacje wynikające z nietypowych zdolności Mikana. Akcja osadzona jest w ciepłej, rodzinnej atmosferze japońskiego miasteczka, gdzie życie mieszkańców nabiera barw dzięki obecności nietypowego pupila. „Mikan Enikki” to pogodna, pełna ciepła i humoru opowieść o przyjaźni, rodzinie i codziennych radościach oraz troskach widzianych oczami wyjątkowego kota.

