„Munou na Nana” to wyjątkowa opowieść o nastolatkach posiadających nadnaturalne zdolności, nazywane „Talentami”. Od 50 lat na całym świecie pojawiają się przerażające stwory, zwane „wrogami ludzkości”. Aby zwalczyć te zagrożenia, młodzież z Talentami szkoli swoje umiejętności na odizolowanej akademii na wyspie. Wśród nich jest Nanao Nakajima, który nie posiada Talentu i często jest celem drwin, ale mimo to, nie przestaje trenować. Kiedy do klasy dołączają tajemniczy Kyouya Onodera i Nana Hiiragi, potrafiąca czytać w myślach, zaczynają dziać się tajemnicze zaginięcia, które zagrażają całej klasie.