„Nana to Kaoru” to historia pełna namiętności i niekonwencjonalnych upodobań. Siedemnastoletni Kaoru marzy o relacji S&M ze swoją przyjaciółką z dzieciństwa, Naną, której uroda i perfekcja przyciągają spojrzenia innych chłopców. Mimo że ostatnio ich przyjaźń nieco osłabła, pewien incydent sprawia, że zaczynają odkrywać nowe aspekty swojej relacji. Kiedy matka Kaoru oddaje Nanzie do przechowania jego zabawki S&M, Nana przypadkiem zamyka się w skórzanej sukni. Po wyzwoleniu Nana, zaczyna zdawać sobie sprawę, że hobby Kaoru może jej się podobać więcej, niż myślała. Wkrótce rozpoczynają wspólne „sesje oddechowe”, mające na celu ulżenie Nanzie w stresie związanym z utrzymaniem doskonałych wyników w nauce.