„Naruto: Shippuuden Movie 6 – Droga do Ninja” to opowieść, w której młodzi ninja wracają do domu po pokonaniu grupy rzekomych członków Akatsuki. Naruto Uzumaki i Sakura Haruno doświadczają jednak innych emocji. Naruto jest zazdrosny o rodziny swoich towarzyszy, pragnąc obecności swoich rodziców. Tymczasem Sakura jest zła na swoich rodziców. Kiedy Nagle pojawia się zamaskowany Madara Uchiha, przenosząc ich do alternatywnego świata. W tym świecie, rodzice Sakura uważani są za bohaterów, a rodzice Naruto są żywi i zdrowi. Naruto i Sakura muszą teraz nie tylko walczyć o dobro Konohagakure z alternatywnego świata, ale także znaleźć drogę powrotną do swojego własnego.