„Natsunagu!” to opowieść o Natsunie Keyaki, która po serii trzęsień ziemi w prefekturze Kumamoto nawiązała kontakt ze swoją najdroższą internetową przyjaciółką, Itsuki. Dysponując jedynie rysunkiem krajobrazu, Natsuna wyrusza w podróż z Tokio do Kumamoto, aby ją odnaleźć. Podczas gdy dziewczyna gubi się w wiejskim obszarze dotkniętym katastrofą, natrafia na policjanta i energiczną uczennicę gimnazjum, Izumi Chiba. Rodzina Izumi oferuje Natsunie schronienie i pomaga jej w poszukiwaniach. Dzięki ich pomocy, Natsuna coraz bardziej zbliża się do odkrycia, co stało się z Itsuki.