Nayuta to opowieść science-fiction, przedstawiająca historię młodej dziewczyny, która pewnego dnia zyskuje niezwykłe moce ESP. Fabuła rozgrywa się w rzeczywistości, gdzie rozwinięte technologie mieszają się z tajemniczymi zjawiskami paranormalnymi. Główna bohaterka, Nayuta, prowadziła do tej pory spokojne życie nastolatki, jednak jej świat wywraca się do góry nogami, gdy odkrywa w sobie nadnaturalny talent. Próbując zrozumieć naturę znaleziska oraz ujarzmić swoje nowo nabyte zdolności, Nayuta szybko zauważa, że granica pomiędzy błogosławieństwem a przekleństwem jest cieńsza, niż podejrzewała. Seria ukazuje zarówno wewnętrzne konflikty bohaterki, jak i zewnętrzne zagrożenia czyhające ze strony tych, którzy pragną kontrolować jej moce. W atmosferze napięcia, zagadek i pełnych emocji momentów Nayuta musi zmierzyć się z własnym przeznaczeniem oraz odnaleźć swoje miejsce w chaosie, jaki nagle ją otacza.
