„Nobunaga no Shinobi: Ise Kanegasaki-hen” opowiada historię Chidori, zarówno śmiercionośnej ninja, jak i uroczej, naiwnej dziewczyny, która nieustannie poszerza horyzonty swego mistrza, Nobunaga Oda, w jego podbojach Kraju Kwitnącej Wiśni. Mimo wielkiego postępu Nobunagi, zjednoczenie narodu nie staje się łatwiejsze, a liczni przeciwnicy nie ustają w próbach zatrzymania ambicji wodza. U boku ambitnego generała stoi jednak wielu bliskich przyjaciół i zwolenników, w tym wierna i zdolna shinobi – Chidori. Służąc w każdy możliwy sposób, Chidori werbuje kluczowych sojuszników, infiltruje zamki wroga i przeżywa pojedynki z utalentowanymi wojownikami, aby pomóc realizować marzenie swojego pana: zjednoczenie Japonii.