„Nyan Koi!” to anime, w którym główny bohater, Junpei Kousaka – drugoroczny uczeń szkoły średniej, cierpi na alergię na koty. Niestety, jest otoczony miłośnikami tych zwierząt: jego rodzina, dawny przyjaciel z dzieciństwa i nawet jego sympatia, Kaede Mizuno, kochają koty.
Pewnego dnia, wracając ze szkoły, Junpei przypadkowo zniszczył głowę posągu bóstwa-kota. W wyniku tego, został on przeklęty, a teraz potrafi rozumieć mowę kotów. Musi jednak utrzymać to w tajemnicy, gdyż dowiedziawszy się o tym, każda osoba staje się bardziej podatna na wypadki.
Pod kierunkiem swojego kota Nyamsusa, Junpei musi teraz wykonać sto dobrych uczynków dla kotów, aby zrzucić klątwę. W przeciwnym razie sam zamieni się w kota, co zważywszy na jego alergię, oznaczałoby jego śmierć!