„Persona 5 the Animation: The Day Breakers” to opowieść o tajemniczej grupie wędrowców zwanej Phantom Thieves of Hearts, która krąży po Tokio, przynosząc sprawiedliwość poprzez kradzież serc skorumpowanych osób. Ta miejska legenda zyskuje na popularności, kiedy coraz więcej ludzi wysyła swoje prośby do kanału Ask-a-Thief, w nadziei na interwencję tej niełatwej do zrozumienia grupy. Kazuya Makigami, złodziej nocą zaczyna mieć wątpliwości co do swoich zbrodni i tych, którzy mu w nich pomagają, więc decyduje się wysłać swoją prośbę.