„Powerful Pro Yakyuu: Powerful Koukou-hen” to opowieść o ambitnym bohaterze, który dołącza do Powerful High School, aby spełnić swoje marzenia o zostaniu baseballistą. Na miejscu spotyka swojego dawnego przyjaciela, Subaru Hoshii, z którym obiecywał kiedyś wystąpić w Letnim Mistrzostwie Szkół Średnich w Koshien, ale Subaru wydaje się zapomnieć o ich obietnicy.