„Qualidea Code” to historia o dzieciach, które zostały kriogeniczne zamrożone w celu ochrony przed brutalnym atakiem istot z innego wymiaru, znanymi jako Unknown. Po kilku latach, gdy ludzkość zdołała się odbudować, dzieci są budzone ze snu i okazuje się, że każde z nich posiadło niesamowite, unikalne moce. Najpotężniejsi z nich otrzymują przydział do odbudowanych miast, broniąc ich przed nieustanną inwazją. W miarę upływu czasu i nieustannych ataków ze strony Unknown, przywódcy miast muszą nauczyć się ze sobą współpracować, by ocalić ostatnią linię obrony przed zagładą ludzkości.