„Ray the Animation” to historia o młodej chirurdze, Ray, która straciła oczy, zanim zdecydowała się wziąć sprawy w swoje ręce. Dziesięć lat temu, rebelujący się chirurg Black Jack uratował ją, zastępując jej oczy unikalnymi sztucznymi prototypami. Dzięki temu Ray zdobyła reputację, wykonując niesamowite operacje, do których nikt inny nie mógł się odważyć. Jednak niewielu wie, że jej misja jest częścią większego celu: odkrycia, co stało się z innymi dziećmi, z którymi dorastała, oraz odnalezienia mężczyzn, którzy zabrali oczy, z którymi się urodziła, by doprowadzić ich do sprawiedliwości.