„Ro-Kyu-Bu! SS” to kontynuacja przygód dziewczęcej drużyny koszykarskiej Akademii Keishin. Po przegranej z Akademią Suzuridani, członkowie zespołu – Tomoka Minato, Maho Misawa, Airi Kashii, Hinata Hakamada i Saki Nagatsuka, pod opieką trenera Subarua Hasegawy, angażują się jeszcze bardziej, aby doskonalić swoje umiejętności. W drodze do szczytu spotkają jednak nowych rywali, których siła może przerastać ich własną, a także nowych przyjaciół.