„Rockman.EXE Beast+” to kontynuacja poprzedniej serii, choć jest uważana za niezależną. Odcinki mają zmniejszoną długość, trwają około dziesięć minut i są emitowane w trzydziestominutowym bloku czasu razem z anime Saru Getchu. Serial składa się z szeregu luk narracyjnych, rozpoczynając od pojawienia się Profesora i Zero, znanych z Mega Man Network Transmission.