„RS Keikaku: Rebirth Storage” to opowieść o świecie, który w 2025 roku jest niszczony przez automatony zwane Kikou. Zniszczyły one wiele miast, a cywilizacja ludzka znalazła się w ruinie. Ocalali ludzie znajdują szczątki Kikou w Japonii i zakładają Instytut Tokyo Kikou (Toukigen) w celu badania ich broni. Za motto przyjmują „defeat poison with poison”, czyli „zwalczaj truciznę za pomocą trucizny” – wykorzystanie Kikou przeciwko Kikou wydaje się ostatnią nadzieją ludzkości. Dziewięć lat później, nowa broń, Muttsu, jest już prawie gotowa do użycia. Chłopiec, Rin Sagami, i dziewczyna, Yuzuru Midou, są wybrani, żeby nią kierować. Czy uda im się ponieść nadzieje na przyszłość ludzkości? Czy odważą się stawić czoła misji, pomimo brutalnego losu, który ich czeka?