„Shin Mazinger Shougeki! Z-hen” to futurystyczna anime, która pokazuje nową rewolucję energetyczną związaną z odkryciem Photon Power. Bezcennym źródłem tej energii jest ruda, znajdująca się u podnóża góry Fuji. Głównym antagonistą jest szalony Dr Hell, którego celem jest przejęcie kontroli nad światem. Wraz ze swoimi pomocnikami wykorzystuje mechaniczne bestie, które odkopuje z ruin starożytnej Grecji. Po stronie dobra staje nastoletni Kabuto Kouji, który zasiada za sterami robota zasilanego Photon Power, stworzonego przez jego dziadka – Mazinger Z. W centrum zmagania znajdują się nie tylko tajemnice dynastii Mykeńskiej i wyspy Bardos, ale także sekrety samego Mazinger Z. Anime to przedstawia zupełnie nową fabułę niezwiązaną z oryginalnym serialem Mazinger Z.