Ekscentryczny, samozwańczy „szalony naukowiec” Rintarou Okabe prowadzi niewielkie laboratorium w tokijskiej dzielnicy Akihabara wraz z grupą bliskich przyjaciół. Pewnego dnia, przypadkiem odkrywa, że skonstruowane przez nich urządzenie, które miało być prostym wynalazkiem, potrafi wysyłać wiadomości w przeszłość, zmieniając tym samym teraźniejszość. Eksperymentując z nową technologią, Okabe i jego zespół szybko dostrzegają konsekwencje manipulacji czasem, które prowadzą do nieprzewidzianych i dramatycznych skutków. Bohaterowie znajdują się uwikłani w skomplikowane intrygi, a także doprowadzeni na skraj moralnych dylematów, gdzie ceną są życie i losy najbliższych. Steins;Gate łączy elementy science-fiction, thrillera psychologicznego oraz dramatu, przedstawiając historię pełną emocji, humoru i wzruszeń na tle fascynującej, nowoczesnej Japonii.